三都友和版电影《你的名字》剧情与动画电影版剧情相差不大，但由于技术、环境、经费等问题，在拍摄手法和表达上，略有不同。

千年一遇的彗星即将掠过地球的消息，像一缕轻烟飘拂在日本的城乡上空，为两个原本毫无交集的年轻人的命运埋下了羁绊的伏笔。

在深山之中的糸守町，17岁的女高中生宫水三叶（新垣结衣饰演）过着压抑又单调的生活。她出身巫女世家，和年幼的妹妹四叶（谷花音）、年迈的外祖母宫水一叶（山村红叶饰演）相依为命。

三叶既要协助外祖母完成神社的古老仪式，穿着传统服饰在同学面前表演口嚼酒的献祭仪式，又要被迫卷入担任町长（镇长）的父亲的选举纷争。

闭塞的小镇、爱唠叨的老人、恶意的同级嘲讽，让三叶对遥远的大都市东京充满了炽热的憧憬，她常常对着天空许愿：“来世请让我做一个东京的帅哥吧！”

与此同时，在东京市中心的高中就读的17岁男生立花泷（孟良辰饰演），正过着截然不同的生活。

他课后在一家意大利餐馆打工，暗恋着温柔漂亮的同事奥寺前辈，闲暇时喜欢用素描本勾勒城市的建筑轮廓，和好友藤井司（熊野义贵饰演）、高木真太（上川大志饰演）一起在咖啡店畅谈未来。

看似充实的生活里，却藏着青春期特有的迷茫，直到一场离奇的梦境打破了这份平静。

某天清晨，三叶在陌生的房间醒来，发现自己竟然变成了男生的模样，周围是东京繁华的街景；而泷则在一间古朴的乡村小屋中睁开眼，胸前的异样触感和镜中扎着红色发绳的少女模样让他惊慌失措。

最初的混乱与无措过后，他们意识到彼此正在睡梦中交换身体。为了不打乱对方的生活，两人约定用手机日记交流，记录下交换期间需要注意的事项：三叶提醒泷不要迟到、好好打工，泷则叮嘱三叶不要勉强自己参与神社仪式。

在互换身体的时光里，他们渐渐融入了彼此的生活。

住进泷身体里的三叶，凭借女孩的细腻与真诚，不仅帮泷处理好了与同学的关系，还在打工时赢得了奥寺前辈（长泽雅美饰演）的好感，甚至大胆地帮泷向奥寺前辈发出了约会邀请。

而住进三叶身体里的泷，则用男生的直率与勇敢，狠狠回击了嘲笑三叶的同学，还凭借出色的绘画天赋帮三叶设计了神社活动的海报，让原本孤僻的三叶赢得了同学们的认可，她与名取早耶香（今田美樱饰演）和敕使河原克彦（山田凉介饰演）的感情更好了。